Мне нужно целой таблице назначить линк site.com.
Опера и Мозилла код понимают, а вот IE не знает, что от него хотят.

<a href="site.com">
<table>
<tr>
<td>bla bla bla</td>
<td>bla bla bla</td>
<td>bla bla bla</td>
</tr>
</table>
</a>

Как дать понять IE что я хочу назначить линк на целую таблицу?

можно продублировать его через onClick...

Можно так попробовать. Хотя не уверен.
a {display:block}

Я бы тоже рекомендовал использовать у таблицы onclick:

<table onclick="location.href = 'http://domain.com';" style="cursor: pointer;">