На странице в файле art есть ссылка на
art.files/teamXs.jpg На сервере будет такая же структура папок: в корне есть файл art и там же папка art.files
Будет ли работать ссылка?
Или нужно писать полный путь, типа Http:\\www.*****.ru/art.files/teamXs.jpg?

пишите абсолютный путь: /art.files/file.ext

другими словами - будет;
и если я правильно понял, то запись /art.files/file.ext будет эквивалентна записи art.files/file.ext (т.е. без префикса "/"), т.к. программа именно так записывает путь к файлам лежащим ниже исходного (art)?

вы складываете файлы в папку art.files
если вы пишете при этом в коде: то при запуске html с локального диска изображение не будет подгружено. А вот если html будет загружаться с сервера, то будет. Если вы будете связываться с версткой под perlscript или phpscript — пишите с префиксом, если же нет — пишите без.

ok, thanks

очень рекомендую прочесть
PHP FAQ: Пути в файловой системе и на сайте.
для понимания, тсзть