1. думаю, имелось в виду, что будет скроль если содержание выходить за заданные размеры окна.
2. всегда использовать одну и ту же функцию, куда передавать новый параметер юрл.
Код:
<a href="javascript:popupOpen('my.htm')">AGA</a>
<a href="javascript:popupOpen('my1.htm')">AGA1</a>
<script>
function popupOpen(urlName)
{
wnd = window.open(urlName, "popup","width=100, height=200, scrollbars=yes, resizable=no")
wnd.focus();
}
</script>