Кто нибудь использует при разработке и поддержке проектов bug tracking? Какие именно? Какие у них имеются плюсы и минусы? Возникла необходимость в чем то подобном и даже не знаю, на чем оставновиться...

Ставили Багзиллу - все ее боялись. Теперь поставили Jira - мне он вроде даже нравится. Про плюсы-минусы сказать не могу :)

Самые популярные:
1) Bugzilla (http://www.bugzilla.org/)
2) Mantis (http://www.mantisbt.org/)
3) Eventum (http://eventum.mysql.org/wiki/index.php/Main_Page)

В принципе этого списка достаточно.

Не знаю, может быть у нас была старая версия какая-то, но Багзиллу я бы не советовал - ужасные диалоги, полубеспорядочные формы, не помещающиеся в экран...